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上海海洋大学现在有3个校区，分别为：浦东新区沪城环路校区、杨浦区军工路校区和杨浦区民星路校区
上海海洋大学前身是建于1912年的江苏省立水产学校，1952年成为国内第一所本科水产高校——上海水产学院，1985年更名为上海水产大学。学校目前有浦东新区沪城环路校区、杨浦区军工路校区、杨浦区民星路校区3个校区，根据上海高校布局结构调整规划，2008年整体搬迁至上海临港新城办学，主校区沪城环路校区占地约1600余亩，规划建设面积58.6万平方米。
1.上海海洋大学浦东新区沪城环路校区
地址：上海海洋大学浦东新区沪城环路校区。上海海洋大学是上海市人民政府与国家海洋局、农业部共建的多科性应用研究型高等学府，前身是张謇、黄炎培创建于1912年的江苏省立水产学校，1952年升格为中国第一所本科水产高校——上海水产学院，1985年更名为上海水产大学，2008年更为现名。1914年9月1日定校训：勤朴忠实。
2.上海海洋大学杨浦区军工路校区
地址：杨浦区军工路334号。学校目前有上海市浦东新区沪城环路校区、杨浦区军工路校区、杨浦区民星路校区3个校区。其中，主校区沪城环路校区占地约1600余亩，规划建设面积58.6万平方米。
3.上海海洋大学杨浦区民星路校区
地址：军工路334号。学校教育体系完备，优势学科明显，研究成果显著。拥有研究生教育、普通本专科教育、继续教育及留学生教育。拥有2个博士后科研流动站、3个一级学科博士学位授权点、10个一级学科硕士学位授权点、4个研究生专业学位授权点、47个本科专业及方向、10个高职专业。